進(jìn)入了明治時(shí)代，曾經(jīng)的“劊子手拔刀齋”緋村劍心（佐藤健 飾）已經(jīng)習(xí)慣了神谷道場的安寧生活。誰知就在這一天，倒幕戰(zhàn)爭時(shí)的舊友——號稱維新三杰之一的大久保利通（宮澤和史 飾）將其請去。原來繼承了劍心劊子手身份的志志雄真實(shí)（藤原龍也 飾）當(dāng)年被新政府背叛，僥幸活下來的志志雄正秘密籌措稱霸日本的可怕計(jì)劃。大久保死后，深感背負(fù)不可推卸責(zé)任的劍心只身上路，在途中不僅偶遇京都女忍卷町操（土屋太鳳 飾），還在新月村和志志雄有了第一次的遭遇。與此同時(shí)，相樂左之助（青木崇高 飾）、神谷薫（武井咲 飾）、明神彌彥（大八木凱斗 飾）、齋藤一（江口洋介 飾）也相繼趕往京都。陰云密布的時(shí)代，醞釀著一場席卷全國的風(fēng)暴……
本片根據(jù)和月伸宏的經(jīng)典漫畫原作改編。
動(dòng)作片