賽菲羅斯的事件已經(jīng)過去2年了，人類從巨大隕石的災(zāi)難之下逃脫。曾經(jīng)繁榮的都市雖然滿目瘡痍，但人們已經(jīng)開始投入重建家園的工作之中。而拯救世界的英雄克勞德，卻過著與世隔絕的生活。
但是，神秘的疾病“星痕癥候群”在世界蔓延。蒂法?洛克哈特決定找尋克勞德。但當(dāng)她找到克勞德之時，眼前這個人，只是一個為艾利斯之死郁郁寡歡的落魄男子。
以繼承賽菲羅斯的遺志而組成的白發(fā)三人組出現(xiàn)在人們眼前，文森特不得不再次揮動雙槍，保護(hù)大家。而世界的英雄，克勞德，能否再次振作，守護(hù)這個世界呢？
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