小學(xué)時(shí)期，游泳部的四名成員在畢業(yè)前的游泳比賽中奪冠，之后他們畢業(yè)的畢業(yè)，出國(guó)的出國(guó)，四人分道揚(yáng)鑣。時(shí)過境遷，就讀巖鳶高中的七瀨遙（島崎信長(zhǎng) 配音）和好朋友橘真琴（鈴木達(dá)央 配音）升上高二，他們與昔日的游泳部成員之一葉月渚（代永翼 配音）重逢。三人回憶起小學(xué)時(shí)光，約定到曾經(jīng)的游泳館去。在廢棄的游泳館里，他們居然遇到了歸國(guó)的松岡凜（宮野真守 配音）。意料之外的是，昔日戰(zhàn)友凜性情大變，還對(duì)遙發(fā)起挑戰(zhàn)，結(jié)果遙輸給了他。
　　遙、真琴和渚決定成立游泳部，經(jīng)過多番努力后，終于招募到了新成員龍崎憐（平川大輔 配音），他們以縣大賽冠軍為目標(biāo)，進(jìn)行緊張的集訓(xùn)。另一方面，凜所在的鮫柄學(xué)院游泳部也在為大賽作準(zhǔn)備。他們約定，要在賽場(chǎng)上決一高下。充滿激情和活力的游泳部，在這個(gè)夏天，開始了關(guān)于友情與青春的Free!故事。