1999年，由于數(shù)碼世界資料異常增生，導(dǎo)致數(shù)碼世界和現(xiàn)實(shí)世界的連接發(fā)生紊亂。地球上相應(yīng)地出現(xiàn)奇怪的自然現(xiàn)象：東南亞沒有下雨，池塘全部干涸；中東卻因?yàn)檫B場大雨發(fā)生洪水；美國則遇到有史以來最寒冷的冬天。
　　11歲的少年八神太一（藤田淑子 配音），和伙伴石田大和（風(fēng)間勇刀 配音）、武之內(nèi)空（水谷優(yōu)子 配音）、泉光子郎（天神有海 配音）、太刀川美美（前田愛 配音）、城戶丈（菊池正美 配音）、高石武（小西寛子 配音）一起參加了夏令營，一次意外卻被神秘地送到了一個多彩的數(shù)碼世界。在那里，他們得到了叫做“數(shù)碼寶貝”的搭檔。進(jìn)入數(shù)碼世界后，八神太一一行人遇到了兇惡的怪獸貝殼獸，眼看大家都要被抓住的時候，太一的亞古獸忽然進(jìn)化成為暴龍獸，拯救了他們。進(jìn)化到底是怎么回事情？數(shù)碼世界究竟是什么？無數(shù)的謎團(tuán)出現(xiàn)在被召選的小朋友們面前，精彩的冒險就這樣開始了……